MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 25046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017186	GTC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017186	CGT	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017186	AGC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017186	CG	3	6	1789	1794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017186	TTGT	2	8	1815	1822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017186	CGA	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017186	ATG	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017186	AGG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017186	CCG	2	6	2111	2116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017186	CCA	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017186	CA	3	6	2216	2221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017186	TACTGC	2	12	2237	2248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017186	TCT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017186	AG	4	8	2263	2270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017186	AACAA	2	10	2271	2280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017186	GTC	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017186	CGG	2	6	2360	2365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017186	CCGG	2	8	2435	2442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017186	TCG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017186	GC	3	6	2518	2523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017186	GGC	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017186	GGC	2	6	5892	5897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017186	GCG	2	6	5901	5906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017186	TCGT	2	8	6555	6562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017186	GGA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017186	GAGC	2	8	6626	6633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017186	GAG	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017186	AAC	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017186	TTC	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017186	CACGG	2	10	11251	11260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017186	GACT	2	8	11266	11273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017186	GGTG	2	8	12127	12134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017186	CTC	2	6	12162	12167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017186	GCA	2	6	12201	12206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017186	CCG	2	6	12241	12246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017186	GCG	2	6	12338	12343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017186	CGA	2	6	12345	12350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017186	GC	3	6	12353	12358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017186	GCA	2	6	12381	12386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017186	AGA	2	6	12458	12463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017186	GAT	2	6	12580	12585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017186	TCT	3	9	12642	12650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017186	TAG	2	6	12664	12669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017186	ACGT	2	8	12719	12726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017186	CAG	2	6	12727	12732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017186	CGG	2	6	12753	12758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017186	GGCG	2	8	12783	12790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017186	GGTG	2	8	12889	12896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017186	TCT	2	6	12920	12925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017186	CG	3	6	12948	12953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017186	CGGC	2	8	12965	12972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017186	GCT	2	6	13136	13141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017186	GC	3	6	13156	13161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017186	GCCG	2	8	13175	13182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017186	GCG	2	6	13194	13199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017186	TGG	2	6	13203	13208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017186	GAC	2	6	13222	13227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017186	CTG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017186	TCG	2	6	13347	13352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017186	CTG	2	6	13356	13361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017186	CGA	2	6	13400	13405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017186	ACGGCC	2	12	13444	13455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017186	CGG	2	6	13468	13473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017186	CGC	2	6	13482	13487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017186	TGC	2	6	13529	13534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017186	CA	3	6	13552	13557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017186	GAG	2	6	13566	13571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017186	GAC	2	6	13624	13629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017186	CTC	2	6	13732	13737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017186	AC	3	6	13743	13748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017186	GAA	2	6	13764	13769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017186	GTC	2	6	14033	14038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017186	TCCT	2	8	14055	14062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017186	CCA	2	6	14141	14146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017186	CGC	2	6	14193	14198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017186	AGC	2	6	14206	14211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017186	CAG	2	6	14300	14305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017186	CAC	2	6	14328	14333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017186	GCC	2	6	14552	14557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017186	GCT	2	6	14603	14608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017186	GGT	2	6	14636	14641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017186	TGC	2	6	14654	14659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017186	CGG	2	6	18139	18144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017186	CGA	2	6	18193	18198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017186	CCA	2	6	18212	18217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017186	CTCG	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017186	CGGC	2	8	18492	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017186	GC	3	6	18498	18503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017186	G	6	6	18509	18514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017186	CCGG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017186	CGTC	2	8	20218	20225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017186	CGT	2	6	20296	20301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017186	TAGT	2	8	20312	20319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017186	CGA	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017186	TAG	2	6	21669	21674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017186	GAA	2	6	21762	21767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017186	CGT	2	6	21793	21798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017186	C	7	7	21801	21807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_017186	GAGT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017186	AG	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017186	TTA	2	6	25420	25425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017186	TG	3	6	25451	25456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017186	CG	3	6	25517	25522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017186	GATC	2	8	25589	25596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017186	TCT	2	6	25619	25624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017186	GTG	3	9	25665	25673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017186	GAC	2	6	25689	25694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017186	GGC	2	6	25710	25715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017186	GTC	2	6	25783	25788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017186	CCA	2	6	25978	25983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017186	CCA	2	6	26425	26430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017186	CAAC	2	8	28095	28102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017186	GCCGTG	2	12	28183	28194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017186	AAGC	2	8	28217	28224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017186	GC	3	6	28427	28432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017186	ACG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017186	TGTCG	2	10	28556	28565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017186	GCG	2	6	33451	33456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017186	TCG	3	9	33498	33506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017186	CAC	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017186	GAAAG	2	10	33516	33525	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017186	CAT	2	6	36130	36135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017186	GGC	2	6	36172	36177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017186	TCG	2	6	37478	37483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017186	GGT	2	6	37491	37496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017186	CAGC	2	8	37508	37515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017186	CA	3	6	37522	37527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017186	CGA	2	6	37556	37561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017186	CGCC	2	8	37575	37582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017186	GTGA	2	8	38102	38109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017186	CGGGG	2	10	38188	38197	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017186	TCA	2	6	39298	39303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017186	CGC	2	6	39361	39366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017186	GGTT	2	8	39920	39927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017186	AACC	2	8	39936	39943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017186	CGC	2	6	39953	39958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017186	TGG	2	6	39984	39989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017186	AGG	2	6	41281	41286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017186	GCC	2	6	41353	41358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017186	TAA	2	6	41367	41372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017186	GT	3	6	41641	41646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017186	TGG	2	6	41673	41678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017186	AGC	2	6	41744	41749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017186	GAG	2	6	41815	41820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017186	CG	3	6	41833	41838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017186	GAC	3	9	41847	41855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017186	GTGG	2	8	43111	43118	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017186	TCC	2	6	43616	43621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017186	CCGG	2	8	43628	43635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017186	GAT	2	6	43659	43664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017186	CAC	2	6	43668	43673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017186	CGG	2	6	45154	45159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_017186	G	6	6	45287	45292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017186	AGG	2	6	45294	45299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017186	CGG	2	6	63700	63705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_017186	CCG	2	6	68235	68240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_017186	CGC	3	9	68257	68265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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270	NC_017186	GA	3	6	107677	107682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017186	CCG	2	6	108346	108351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_017186	GCC	2	6	109207	109212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_017186	CCGGG	2	10	109213	109222	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
274	NC_017186	TGG	2	6	109255	109260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017186	CAG	2	6	109334	109339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017186	GTG	2	6	109359	109364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017186	GTTTCC	2	12	110751	110762	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017186	TTGAA	2	10	110764	110773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017186	CGG	2	6	113381	113386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017186	CAC	2	6	113465	113470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_017186	C	6	6	113512	113517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
282	NC_017186	GGGC	2	8	113561	113568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
283	NC_017186	GA	3	6	113614	113619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017186	CGT	2	6	113652	113657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_017186	GCC	2	6	114912	114917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_017186	GTC	2	6	116348	116353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_017186	GTT	3	9	117852	117860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_017186	CCT	2	6	120666	120671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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415	NC_017186	TCC	2	6	167921	167926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
416	NC_017186	TCG	2	6	167941	167946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_017186	CGG	2	6	170784	170789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_017186	CCCGG	2	10	171851	171860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
420	NC_017186	GGA	2	6	173492	173497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017186	CTC	2	6	174571	174576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_017186	GCCGC	2	10	177791	177800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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424	NC_017186	CG	4	8	177847	177854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_017186	CGA	2	6	177898	177903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_017186	CGA	2	6	178167	178172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_017186	GGC	2	6	180118	180123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_017186	GGC	2	6	180316	180321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_017186	ACC	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_017186	TCG	2	6	186955	186960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_017186	CTC	2	6	192452	192457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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